Нужно создать локальную ветку и запушить. Ссылки: http://www.jetbrains.com/phpstorm/webhelp/creating-a-new-branch.html http://www.jetbrains.com/phpstorm/webhelp/uploading-a-local-git-repository-push.html http://devnet.jetbrains.net/message/5455304?tstart=0